一．师范部理科（1921年2月）
刘树杞（化学，1921年）2
二．理学部（1921年8月）
刘树杞（化学，1921年）
三．理科（1923年4月）
刘树杞（1924年代理，1926年）
余泽兰（1924年）3
胡刚复（物理学，1927年）
钟心煊（植物学，1928年代理）
四．理学院（1930年2月）
张资珙（化学，1930年）
陈子英（生物学，1931年代理）
张希陆（数学，1934年）
刘 椽（化学，1935年）
蔡镏生（化学，1938年）
谢玉铭（物理学，1939年）
五．理工学院（1940年9月）
谢玉铭（物理学，1940年）
傅 鹰（化学，1942年）
汪德耀（生物，1943年）
黄巷林（物理、航空，1944年）
六．理学院（1948年7月）
黄巷林（物理、航空，1948年6月）
崔九卿（物理，1948年7月）
古文捷（数理，1949年兼）
卢嘉锡（化学，1949年）
七．1952年撤销学院建制。
八．1980年代开始，学校陆续恢复、组建理科学院建制。
（资料整理：金能明、林清育、叶雅璇）
1如无标注，均摘自《厦大校史资料》第五辑。负责人所属学科系根据其个人简介资料。
2《厦大校史资料》第一卷第13页。
3《厦大校史资料》第一卷第41页。
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